MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Burkholderia sp. RPE64 plasmid p1 DNA

Total Repeats: 31438

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021289	TCGA	2	8	143	150	25 %	25 %	25 %	25 %	507518296
2	NC_021289	GCC	2	6	167	172	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507518296
3	NC_021289	GC	3	6	234	239	0 %	0 %	50 %	50 %	507518296
4	NC_021289	AGC	2	6	285	290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507518296
5	NC_021289	ACC	2	6	305	310	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	507518296
6	NC_021289	CCG	2	6	324	329	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507518296
7	NC_021289	CG	3	6	392	397	0 %	0 %	50 %	50 %	507518296
8	NC_021289	GAC	2	6	478	483	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507518296
9	NC_021289	GCT	2	6	514	519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507518296
10	NC_021289	GCC	2	6	522	527	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507518296
11	NC_021289	GCT	2	6	616	621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507518296
12	NC_021289	CGT	3	9	702	710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507518296
13	NC_021289	CT	3	6	711	716	0 %	50 %	0 %	50 %	507518296
14	NC_021289	CGT	2	6	785	790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507518296
15	NC_021289	CGA	2	6	808	813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507518296
16	NC_021289	ACG	2	6	816	821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507518296
17	NC_021289	ATC	2	6	827	832	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	507518296
18	NC_021289	CGC	2	6	837	842	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507518296
19	NC_021289	CTG	2	6	872	877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507518296
20	NC_021289	CTG	2	6	893	898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507518296
21	NC_021289	GCCC	2	8	903	910	0 %	0 %	25 %	75 %	507518296
22	NC_021289	CA	3	6	934	939	50 %	0 %	0 %	50 %	507518296
23	NC_021289	GAA	2	6	967	972	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	507518296
24	NC_021289	CGA	2	6	1039	1044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507518296
25	NC_021289	CG	3	6	1050	1055	0 %	0 %	50 %	50 %	507518296
26	NC_021289	GGCT	2	8	1064	1071	0 %	25 %	50 %	25 %	507518296
27	NC_021289	TGC	2	6	1095	1100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507518296
28	NC_021289	GCA	2	6	1182	1187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507518296
29	NC_021289	GTTC	2	8	1249	1256	0 %	50 %	25 %	25 %	507518296
30	NC_021289	GATG	2	8	1396	1403	25 %	25 %	50 %	0 %	507518297
31	NC_021289	GCGG	2	8	1465	1472	0 %	0 %	75 %	25 %	507518297
32	NC_021289	GAA	2	6	1552	1557	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	507518297
33	NC_021289	CGCCA	2	10	1579	1588	20 %	0 %	20 %	60 %	507518297
34	NC_021289	ATC	2	6	1625	1630	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	507518297
35	NC_021289	CGC	2	6	1648	1653	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507518297
36	NC_021289	GAA	2	6	1703	1708	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	507518297
37	NC_021289	TTC	2	6	1730	1735	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	507518297
38	NC_021289	CTG	2	6	1742	1747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507518297
39	NC_021289	T	6	6	1869	1874	0 %	100 %	0 %	0 %	507518297
40	NC_021289	AGC	2	6	1894	1899	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507518297
41	NC_021289	GCG	2	6	1958	1963	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507518297
42	NC_021289	CGC	2	6	2006	2011	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507518297
43	NC_021289	CGA	3	9	2017	2025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507518297
44	NC_021289	TGT	2	6	2095	2100	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	507518297
45	NC_021289	GAA	2	6	2109	2114	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	507518297
46	NC_021289	CGT	2	6	2146	2151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507518297
47	NC_021289	CGTT	2	8	2155	2162	0 %	50 %	25 %	25 %	507518297
48	NC_021289	TCA	2	6	2217	2222	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	507518297
49	NC_021289	CGC	2	6	2635	2640	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507518298
50	NC_021289	GATC	2	8	2682	2689	25 %	25 %	25 %	25 %	507518298
51	NC_021289	CCTT	2	8	2693	2700	0 %	50 %	0 %	50 %	507518298
52	NC_021289	GCT	2	6	2715	2720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507518298
53	NC_021289	CGCTCG	2	12	2750	2761	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	507518298
54	NC_021289	GCTT	2	8	2764	2771	0 %	50 %	25 %	25 %	507518298
55	NC_021289	CG	3	6	2798	2803	0 %	0 %	50 %	50 %	507518298
56	NC_021289	CGC	2	6	2810	2815	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507518298
57	NC_021289	CG	3	6	2822	2827	0 %	0 %	50 %	50 %	507518298
58	NC_021289	TCA	2	6	2908	2913	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	507518298
59	NC_021289	CCCG	2	8	2914	2921	0 %	0 %	25 %	75 %	507518298
60	NC_021289	GCC	2	6	3015	3020	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507518298
61	NC_021289	CGA	2	6	3035	3040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507518298
62	NC_021289	CG	5	10	3041	3050	0 %	0 %	50 %	50 %	507518298
63	NC_021289	CCGTC	2	10	3088	3097	0 %	20 %	20 %	60 %	507518298
64	NC_021289	TA	4	8	3119	3126	50 %	50 %	0 %	0 %	507518298
65	NC_021289	TCA	2	6	3143	3148	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	507518298
66	NC_021289	CTG	2	6	3189	3194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507518298
67	NC_021289	CTT	2	6	3258	3263	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	507518298
68	NC_021289	GTC	2	6	3270	3275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507518298
69	NC_021289	CG	3	6	3300	3305	0 %	0 %	50 %	50 %	507518298
70	NC_021289	GC	3	6	3338	3343	0 %	0 %	50 %	50 %	507518298
71	NC_021289	CGCA	2	8	3369	3376	25 %	0 %	25 %	50 %	507518298
72	NC_021289	CGGA	2	8	3396	3403	25 %	0 %	50 %	25 %	507518298
73	NC_021289	GAG	2	6	3420	3425	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	507518298
74	NC_021289	TCGT	2	8	3459	3466	0 %	50 %	25 %	25 %	507518298
75	NC_021289	CGA	2	6	3500	3505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507518298
76	NC_021289	TCA	2	6	3520	3525	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	507518298
77	NC_021289	GAA	2	6	3534	3539	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	507518298
78	NC_021289	CG	3	6	3547	3552	0 %	0 %	50 %	50 %	507518298
79	NC_021289	GCC	2	6	3620	3625	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507518298
80	NC_021289	AC	3	6	3672	3677	50 %	0 %	0 %	50 %	507518298
81	NC_021289	CG	3	6	3702	3707	0 %	0 %	50 %	50 %	507518298
82	NC_021289	TTC	2	6	3754	3759	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	507518298
83	NC_021289	AAGC	2	8	3765	3772	50 %	0 %	25 %	25 %	507518298
84	NC_021289	GTT	2	6	3836	3841	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	507518298
85	NC_021289	AGC	2	6	3878	3883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507518298
86	NC_021289	TCG	2	6	4257	4262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507518299
87	NC_021289	GC	3	6	4268	4273	0 %	0 %	50 %	50 %	507518299
88	NC_021289	CAG	2	6	4278	4283	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507518299
89	NC_021289	CAAGG	2	10	4298	4307	40 %	0 %	40 %	20 %	507518299
90	NC_021289	AGCGTC	2	12	4362	4373	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	507518299
91	NC_021289	GC	4	8	4378	4385	0 %	0 %	50 %	50 %	507518299
92	NC_021289	ACGC	2	8	4418	4425	25 %	0 %	25 %	50 %	507518299
93	NC_021289	ACC	2	6	4437	4442	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	507518299
94	NC_021289	GCT	3	9	4543	4551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507518299
95	NC_021289	CGT	2	6	4570	4575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507518299
96	NC_021289	GCT	2	6	4690	4695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507518299
97	NC_021289	CG	3	6	4698	4703	0 %	0 %	50 %	50 %	507518299
98	NC_021289	GAT	2	6	4750	4755	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	507518299
99	NC_021289	AGTCG	2	10	4813	4822	20 %	20 %	40 %	20 %	507518299
100	NC_021289	CGA	2	6	4837	4842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507518299
101	NC_021289	GAAG	2	8	4858	4865	50 %	0 %	50 %	0 %	507518299
102	NC_021289	GAA	3	9	4874	4882	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	507518299
103	NC_021289	ACG	2	6	4902	4907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507518299
104	NC_021289	GAA	2	6	4931	4936	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	507518299
105	NC_021289	CGA	2	6	4939	4944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507518299
106	NC_021289	GAC	2	6	4952	4957	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507518299
107	NC_021289	GCG	2	6	4974	4979	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507518299
108	NC_021289	CGAA	2	8	4992	4999	50 %	0 %	25 %	25 %	507518299
109	NC_021289	GC	3	6	5073	5078	0 %	0 %	50 %	50 %	507518299
110	NC_021289	GCG	4	12	5093	5104	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507518299
111	NC_021289	GTC	2	6	5108	5113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507518299
112	NC_021289	CAG	2	6	5198	5203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507518299
113	NC_021289	TGC	2	6	5238	5243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507518299
114	NC_021289	CG	3	6	5271	5276	0 %	0 %	50 %	50 %	507518299
115	NC_021289	TCG	2	6	5283	5288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507518299
116	NC_021289	GAC	2	6	5323	5328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507518299
117	NC_021289	GC	3	6	5329	5334	0 %	0 %	50 %	50 %	507518299
118	NC_021289	AGC	2	6	5394	5399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507518299
119	NC_021289	CATCGA	2	12	5407	5418	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	507518299
120	NC_021289	GAT	2	6	5509	5514	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	507518299
121	NC_021289	AAG	2	6	5549	5554	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	507518299
122	NC_021289	TGA	2	6	5610	5615	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	507518299
123	NC_021289	GTG	2	6	5671	5676	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	507518299
124	NC_021289	TCGC	2	8	5699	5706	0 %	25 %	25 %	50 %	507518299
125	NC_021289	GC	3	6	5714	5719	0 %	0 %	50 %	50 %	507518299
126	NC_021289	CAA	2	6	5755	5760	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	507518299
127	NC_021289	CG	3	6	5775	5780	0 %	0 %	50 %	50 %	507518299
128	NC_021289	GCA	2	6	5788	5793	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507518299
129	NC_021289	AGC	2	6	5880	5885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507518299
130	NC_021289	CGGT	2	8	5904	5911	0 %	25 %	50 %	25 %	507518299
131	NC_021289	CGG	2	6	5967	5972	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507518299
132	NC_021289	GCC	2	6	5975	5980	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507518299
133	NC_021289	TGCA	2	8	5982	5989	25 %	25 %	25 %	25 %	507518299
134	NC_021289	GC	3	6	5995	6000	0 %	0 %	50 %	50 %	507518299
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138	NC_021289	GAA	2	6	6095	6100	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	507518299
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267	NC_021289	TTGC	2	8	11546	11553	0 %	50 %	25 %	25 %	507518305
268	NC_021289	AAACGC	2	12	11575	11586	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	507518305
269	NC_021289	CAT	2	6	11600	11605	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	507518305
270	NC_021289	GC	3	6	11629	11634	0 %	0 %	50 %	50 %	507518305
271	NC_021289	CGA	2	6	11662	11667	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507518305
272	NC_021289	CTCG	2	8	11699	11706	0 %	25 %	25 %	50 %	507518305
273	NC_021289	CGGT	2	8	11728	11735	0 %	25 %	50 %	25 %	507518305
274	NC_021289	CG	3	6	11782	11787	0 %	0 %	50 %	50 %	507518305
275	NC_021289	GAT	2	6	11825	11830	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	507518305
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280	NC_021289	GC	3	6	12101	12106	0 %	0 %	50 %	50 %	507518306
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301	NC_021289	CG	3	6	12940	12945	0 %	0 %	50 %	50 %	507518307
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385	NC_021289	GCGG	2	8	15771	15778	0 %	0 %	75 %	25 %	507518309
386	NC_021289	GAAG	2	8	15791	15798	50 %	0 %	50 %	0 %	507518309
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389	NC_021289	GAG	2	6	15909	15914	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	507518309
390	NC_021289	GCG	2	6	15915	15920	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507518309
391	NC_021289	CAT	2	6	15929	15934	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	507518309
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393	NC_021289	GAT	2	6	16019	16024	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	507518309
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